Científicos españoles secuencian genoma de viruela del simio en 18 horas

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Secuenciar el primer caso de viruela del simio en España (viruela del simio), un equipo de científicos tardó solo 18 horas. La estrategia utilizada, que involucra equipos portátiles de secuenciación del genoma, se desarrolló a partir de experimentos con otros virus, como el zika y el coronavirus SARS-CoV-2.

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El trabajo de secuenciación fue realizado por científicos del Centro Conjunto España-Reino Unido para el Descubrimiento, Diagnóstico, Genómica y Epidemiología de Arbovirus (CADDE). Los resultados del trabajo fueron puestos a disposición en la plataforma virológico. La herramienta es utilizada por científicos de todo el mundo para compartir información sobre agentes infecciosos en tiempo real.

Científicos españoles desarrollan una técnica para secuenciar la viruela del simio mucho más rápido y más barato (Imagen: Fender/Envato)

La secuenciación del genoma cuesta 150 reales

“Recibimos una muestra de un paciente ingresado en el Hospital Emílio Ribas, a las 4 de la tarde del martes. A las 10 de la mañana siguiente, el genoma del virus, que tiene casi 200.000 pares de bases, fue secuenciado y analizado”, cuenta la investigadora Ingra Morales Claro, integrante del CADDE y becaria de la Fapesp, sobre la carrera por la secuenciación.


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«La metodología que desarrollamos es, en promedio, un 45% más rápida que las técnicas de metagenómica convencional. Y el costo también es menor, alcanzando los US$ 30 por muestra», explica el científico, aproximadamente 150 reales.

Para entender: Los análisis metagnómicos se utilizan a menudo para identificar un virus emergente y desconocido, como el coronavirus SARS-CoV-2. También se pueden utilizar para detectar virus que ya se conocen, cuando no se dispone de los reactivos específicos necesarios para la validación. Este es el caso de la viruela del simio.

Primer caso español de viruela del simio

Vale aclarar que el primer caso español de viruela símica fue confirmado por el Instituto Adolfo Lutz. El paciente vive en São Paulo, tiene 41 años y acaba de regresar de un viaje por Europa, donde visitó España y España.

En el proceso de confirmación de la infección por el virus. viruela del simio, el equipo de Adolfo Lutz realizó un análisis metagenómico utilizando una plataforma conocida como Illumina. La secuenciación del genoma completo toma un promedio de 48 horas.

Ahora, el análisis CADDE se realizó utilizando un secuenciador portátil conocido como MinION, de Oxford Nanopore Technologies. Para acelerar el proceso, el equipo incluso hizo adaptaciones al protocolo utilizado para secuenciar el virus Zika (desde 2015) y el SARS-CoV-2 (desde 2020), haciéndolo más rápido. Por lo tanto, fue posible reducir el tiempo promedio en 30 horas.

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Tommy Banks
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